Bakterie są wszędzie wokół nas, w powietrzu, na przedmiotach i zwykle znajdują się w ludzkim ciele. Kiedy bakterie znajdują się na ludzkim ciele przy braku choroby, nazywa się je kolonizatorem. Jednak ludzie mogą zarazić się patogennymi bakteriami z pożywienia, wody, otarć i innych ran, a nawet bakterii kolonizujących, jeśli dostaną się one do normalnie sterylnej części ciała. Patogenna bakteria to choroba wywołująca choroby u gospodarza. Lista bakterii chorobotwórczych jest dość duża, ale niektóre z nich są częstymi przyczynami chorób u ludzi.
Staphylococcus
Grupa bakterii znanych jako gronkowce, szczególnie Staphylococcus aureus, jest jedną z najczęstszych przyczyn chorób ludzi. Większość gronkowców skolonizuje skórę i błony śluzowe osób bez chorób. Jednak, biorąc pod uwagę właściwe warunki, gronkowce mogą powodować powierzchowne i ogólnoustrojowe infekcje. Niektóre z bardziej powszechnych infekcji powierzchownych spowodowanych przez S. aureus to czyraki, liszajec i zapalenie mieszków włosowych. Poważniejsze i powszechne infekcje powodowane przez ten organizm to zapalenie płuc, bakteriemia oraz infekcje kości i ran. Staphylococcus aureus może również wytwarzać toksyny, które mogą powodować tak różnorodne choroby, jak zatrucie pokarmowe i zespół wstrząsu toksycznego.
Innymi gatunkami gronkowców, które często wywołują choroby u ludzi, jest Staphylococcus saprophyticus. Jest to częsta przyczyna zakażeń dróg moczowych u kobiet aktywnych seksualnie.
Paciorkowiec
Podobnie jak gronkowce, istnieje wiele gatunków paciorkowców normalnie występujących w ludzkim ciele. Niektóre szczepy paciorkowców powodują niektóre z najpoważniejszych chorób u ludzi. Streptococcus pyogenes (grupa paciorkowca A) jest główną przyczyną bakteryjnego zapalenia gardła (anginy angina) u ludzi. Nieleczone gardło może prowadzić do poważnych następstw, takich jak gorączka reumatyczna (zastawki serca) i kłębuszkowe zapalenie nerek (nerki). Inne infekcje obejmują liszajec i wyniszczające "bakterie żyjące w ciele", zwane inaczej martwiczym zapaleniem powięzi. W martwiczym zapaleniu powięzi dochodzi do szybkiej destrukcji tkanek miękkich i mięśni. Jest to często śmiertelna choroba i konieczne jest szybkie leczenie.
Gram-ujemne Bacilli
Istnieją dziesiątki różnych gatunków bakterii Gram-ujemnych, a wiele gatunków zwykle znajduje się w jelitach. W przewodzie jelitowym mają korzystny wpływ na organizm, zapobiegając nadmiernemu wzrostowi potencjalnych patogenów. Jeśli jednak po zabiegu chirurgicznym lub urazie te bakterie wydostaną się z jelita, mogą spowodować poważną, zagrażającą życiu chorobę. Jednym z częściej występujących bakterii Gram-ujemnych wywołujących choroby u ludzi jest Escherichia coli. Według Bailey i Scott "Diagnostic Microbiology", E. coli jest zdecydowanie najczęstszą przyczyną nieskomplikowanych infekcji nabytych w obrębie układu moczowego i często występuje w zakażeniach ran. Niektóre szczepy E. coli (takie jak E. coli O157: H7) mogą powodować poważną biegunkę i uszkodzenie nerek.
Salmonella i Shigella to dwie grama ujemne, dobrze znane z powodu zatrucia pokarmowego i czerwonki.
Gram-ujemne prątki mają wpływ na infekcje tak różne, jak zapalenie płuc na infekcje ucha.
Neisseria
Większość gatunków Neisseria występuje normalnie w jamie ustnej i żeńskich narządach płciowych. Istnieją jednak dwa gatunki, które mogą powodować bardzo poważne choroby u ludzi.
Neisseria gonorrhoeae jest przyczyną rzeżączki przenoszonej drogą płciową. Jest to poważny problem zdrowia publicznego w Stanach Zjednoczonych i na świecie. Nieleczona infekcja rzeżączki może prowadzić do cięższych chorób, takich jak gonokokowe zapalenie stawów i choroba zapalna miednicy mniejszej (PID).
Neisseria meningitis jest czynnikiem wywołującym meningokokowe zapalenie opon mózgowych, poważną, potencjalnie zagrażającą życiu chorobą płynu mózgowo-rdzeniowego i opon mózgowych.